Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSPNQ9HAW4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms