Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms