Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF17Q9BXT8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms