Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG6Q9BXT2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms