Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBB2BQ9BVA1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms