Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TIMM29Q9BSF4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TIMM29Q9BSF4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms