Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD2Q9BSE4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms