Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BPIFA3Q9BQP9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms