Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRPF18Q99633 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms