Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSF3RQ99062 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSF3RQ99062 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms