Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms