Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HMCN1Q96RW7 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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