Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms