Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms