Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC9Q96Q05 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms