Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC17Q96LX7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC17Q96LX7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms