Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ1Q96JM4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ1Q96JM4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms