Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RNF185Q96GF1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms