Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVB12AQ96EY5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MVB12AQ96EY5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms