Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HLA-CQ95604 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-CQ95604 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms