Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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BEST4Q8NFU0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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