Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms