Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCDD1LQ8NCL9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms