Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms