Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NPAS3Q8IXF0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NPAS3Q8IXF0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms