Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
WDR53Q7Z5U6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
WDR53Q7Z5U6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms