Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP31Q70CQ4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms