Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms