Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms