Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM9

PRR27, Proline-rich protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR27Q6MZM9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PRR27Q6MZM9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms