Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM236Q5W0B7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM236Q5W0B7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms