Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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COL5A1-AS1Q5SY13 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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