Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHYHD1Q5SRE7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms