Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LETM2Q2VYF4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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