Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MICAQ29983 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MICAQ29983 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms