Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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COL24A1Q17RW2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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