Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDO1Q16878 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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