Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FXNQ16595 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FXNQ16595 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FXNQ16595 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FXNQ16595 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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