Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
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SGCAQ16586 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCAQ16586 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SGCAQ16586 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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SGCAQ16586 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SGCAQ16586 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCAQ16586 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCAQ16586 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SGCAQ16586 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SGCAQ16586 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SGCAQ16586 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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SGCAQ16586 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SGCAQ16586 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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