Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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