Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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