Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms