Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms