Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN9AQ15858 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SCN9AQ15858 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCN9AQ15858 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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