Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms