Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMC1AQ14683 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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