Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC3Q14574 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms