Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HNF4GQ14541 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HNF4GQ14541 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms