Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTAN1Q13813 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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