Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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